A FAPESB foi criada com o objetivo de estimular e apoiar o desenvolvimento das atividades científicas e tecnológicas do Estado da Bahia. Por isso, busca a inserção plena da ciência e da tecnologia na solução de problemas econômicos e sociais que afetam o desenvolvimento sustentável da economia baiana.
Para viabilizar seus esforços, criou o Programa de Apoio a Pesquisa na Empresa – Bahia Inovação, que busca disseminar os programas e projetos de apoio nacionais e estaduais que possam fomentar as principais atividades das áreas prioritárias do Estado, com o objetivo de promover o desenvolvimento da inovação e do empreendedorismo, especialmente para o estímulo à cooperação entre as empresas, as instituições de ensino superior, os centros de pesquisa, organizações não governamentais e o governo.
O Programa Bahia Inovação é composto pelas seguintes ações:
1. PAPPE Subvenção Econômica (Tecnova) (em parceria com Finep)
2. Pesquisador na Empresa
3. Apoio à Inovação Aberta
4. Apoio à Cooperação entre Empresas e Instituições Científicas e Tecnológicas – ICTs
5. Apoio a Projetos Cooperativos com Grandes Empresas
6. Programa de Desenvolvimento de Recursos Humanos em Apoio à Pesquisa e à Inovação no Parque Tecnológico da Bahia – Bolsas ProPARQ