De acordo com a Finep, são considerados prioritários os seguintes setores econômicos e áreas do conhecimento:
• Aeroespacial
• Aeronáutico
• Biotecnologia
• Complexo da saúde
• Defesa
• Desenvolvimento social e tecnologia assistiva
• Energias renováveis
• Nanotecnologia
• Novos materiais
• Petróleo e gás
• Tecnologias da informação e comunicação
• Tecnologias limpas
